데이터셋
1. 데이터 소개
a. 데이터 설명 :
인공지능 모델 개발을 위해 가공된 암세포주 돌연변이 존재여부/위치정보 및 암세포주에 투여된 약물의 분자 정보.
Raw data는 GDSC, CCLE에서 제공받았으며, 약물의 분자 정보는 SMILES 데이터를 이용하여 PaDEL-Descriptor를 이용하여 계산되었습니다.
2. 종(Organism): Homo sapiens (cancer cell line)
3. 데이터 타입: numpy (.npz)
4. 레퍼런스 및 출판된 논문 정보:
A Deep Learning Model for Cell Growth Inhibition IC50 Prediction and Its Application for Gastric Cancer Patients. International journal of molecular sciences, 20(24), 6276. https://doi.org/10.3390/ijms20246276 (2019)
6. Citation 방법:
Joo M, Park A, Kim K, et al. A Deep Learning Model for Cell Growth Inhibition IC50 Prediction and Its Application for Gastric Cancer Patients. Int J Mol Sci. 2019;20(24):6276. Published 2019 Dec 12. doi:10.3390/ijms20246276
7. 추가설명 : https://github.com/labnams/DeepIC50
8. 대표이미지 :
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|---|---|---|---|
| DeepIC50_input_dataset.npz | 0 |
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자원탐색 가이드
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1 공개정도
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자원(데이터셋, 분석도구, 기타서비스)
- 전체공개 : 별도의 승인 절차 없이 파일 미리보기 및 다운로드가 가능하다.
- 비공개 : 관리자 및 등록자의 승인후 파일 미리보기 및 다운로드가 가능하다.
-
커뮤니티
- 전체공개 : 별도의 승인 절차 없이 참여 및 활동이 가능하다.
- 비공개 : 개설자의 승인 후 참여 및 활동이 가능하다.
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자원(데이터셋, 분석도구, 기타서비스)
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2 등록유형
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- 데이터셋: 데이터의 모임
- 분석도구: 데이터를 분석하기 위한도구
- 기타서비스: 기업또는 기관에서 생산한자원
- 연구자: 마켓플레이스에 자원을공유하고 협업을 원하는 연구자
- 협업커뮤니티 : 공통의 주제와 목표를가지고 함께 연구하고 토론하는 공간
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4 자원탐색(비공개 자원 공유 요청)
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- 해당 자원의 파일을 열람하길 희망하는 사용자는 파일 공개 요청 버튼을 클릭하여 관리자 및 등록자의 승인을 받은 경우 파일미리보기 및 다운로드가 가능하다.
- 공개요청한 내역은 “마이플레이스” 혹은 “마이페이지”에서확인할 수 있다.
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5 자원탐색(비공개 커뮤니티 참여신청)
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- 해당 협업커뮤니티에 참여하기 희망하는 사용자는 참여신청 버튼을 클릭하여 개설자의 승인을 받은 이후 커뮤니티 참여 및 활동이가능하다.
- 참여신청한 내역은 “마이플레이스” 혹은 “마이페이지”에서확인할 수 있다.
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자원등록 가이드
자원등록
로그인 후 협업을 위한유형별 신규 자원등록이 가능하다.
자원등록 상세
협업매칭 가이드
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1 등록유형
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- 데이터셋: 데이터의 모임
- 분석도구: 데이터를 분석하기 위한도구
- 기타서비스: 기업또는 기관에서 생산한자원
- 연구자: 마켓플레이스에 자원을공유하고 협업을 원하는 연구자
- 협업커뮤니티 : 공통의 주제와 목표를가지고 함께 연구하고 토론하는 공간
- 자유토론방 : 유형을 구분하지 않고자유롭게 토론할 수 있는 게시글 작성
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마이플레이스 가이드
마이플레이스
로그인 한 사용자가마켓플레이스 활동을 종합 관리할 수 있습니다.
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1 탭 메뉴 안내
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- 커뮤니티 : 참여하고 있는 커뮤니티 목록을 확인할 수 있습니다.
- 관심분야 : 연구자 등록 시 입력한 관심분야 및 키워드를 확인, 수정, 삭제할수 있습니다.
- 연구실적 : 연구자등록 시 입력한 실적을 확인, 수정, 삭제할수 있습니다.
- 등록자원 : 마켓플레이스에등록한 모든 자원을 확인할 수 있습니다.
- 보낸요청 : 비공개 자원 및 커뮤니티에 대해 공개요청 혹은 참여신청한 내역을 확인할 수 있습니다.
- 받은요청 : 비공개로 등록한 자원 및 커뮤니티에 대해 공개요청 혹은 참여신청 받은 내역을 확인할 수 있습니다.
- 관심등록 : 관심등록한 목록을 확인할 수 있습니다.
- 협업매칭 : 협업매칭에 수요 등록한 목록을 확인할 수 있습니다.
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3 보낸요청 목록의 승인상태
- 협업커뮤니티
- 승인 : 타 연구자가 개설한 비공개 협업커뮤니티에 참여신청한 이후 승인을 받은 상태
- 분석도구: 데이터를 분석하기 위한도구
- 거절 : 타 연구자가 개설한 비공개 협업커뮤니티에 참여신청한 이후 거절 받은 상태
- 참여 승인대기중 : 타 연구자가 개설한 비공개 협업커뮤니티에 참여신청한 이후 승인 대기중인 상태
- 초대 승인대기중 : 본인이 개설한 협업커뮤니티에 타 연구자를 초대하고 승인 대기중인 상태
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자원
- 공개신청 승인 : 타 연구자에게 공개신청한 이후 승인을 받은 상태
- 공개신청(승인대기) : 타 연구자에게 공개신청한 이후 승인 대기중인 상태
- 공개신청 거절 : 타 연구자에게 공개신청한 이후 거절 받은 상태
- 협업커뮤니티
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4 받은요청 목록의 승인상태
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협업커뮤니티
- 승인 : 타 연구자가 개설한 협업커뮤니티 초대에 승인한 상태
- 거절 : 타 연구자가 개설한 협업커뮤니티 초대를 거절한 상태
- 초대 승인대기중 : 타 연구자가 개설한 협업커뮤니티 초대를 받은 후 승인 대기중인 상태
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협업커뮤니티
- 공개신청 승인 : 비공개로 등록한 자원에 대해 공개신청을 승인한 상태
- 공개신청 거절 : 비공개로 등록한 자원에 대해 공개신청을 거절한 상태
- 공개신청(승인대기) : 비공개로 등록한 자원에 대해 공개신청을 승인 대기중인 상태
- 공개신청(관리자 승인대기중) : 비공개로 등록한 자원에 대해 관리자가 승인 대기중인 상태
- 공개신청(관리자 승인) : 비공개로 등록한 자원에 대해 관리자가 승인한 상태
- 공개신청(관리자 거절) : 비공개로 등록한 자원에 대해 관리자가 거절한 상태
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협업커뮤니티
자원공유 가이드
자원공유
마켓플레이스에 자원을 등록하고, 검색 및 조회할 수 있다.
1. 등록유형
- 데이터셋 : 데이터의 모임
- 분석도구 : 데이터를 분석하기 위한 도구
- 연구지원서비스(기업) : 기업 또는 기관에서 생성한 자원
- 연구자 : 마켓플레이스에 자원을 공유하고 협업을 원하는 연구자로, 매칭어드바이저 메뉴를 통해 검색 및 조회할 수 있다.
2. 공개정도
- 공개 : 별도의 승인 절차 없이 파일 미리보기 및 다운로드가 가능하다.
- 비공개 : 자원 등록 연구자의 승인 후 파일 미리보기 및 다운로드가 가능하다.
3. 비공개 자원 공유 요청
- 해당 자원의 파일을 열람하길 희망하는 사용자는 파일 "공유 요청" 버튼을 클릭하여 자원 등록 연구자의 승인을 받은 후 미리보기 및 다운로드 할 수 있다.
- 공유 요청한 내역은 마이페이지-마켓플레이스 관리 메뉴를 통해 확인 할 수 있다.
동영상 매뉴얼
자원등록 가이드
커뮤니티 가이드
협업인사이트 가이드
협업인사이트
협업 네트워크 분석 및 가시화 서비스로 바이오 연구 협업에 관심이 높은 연구자를 위해 협업 네트워크 정보, 분야별 협업 우수 기관 정보를 제공하고 있다.
협업인사이트 List
동영상 매뉴얼
매칭어드바이저 가이드
매칭어드바이저
협업 후보 연구자 탐색 지원 서비스로 K-BDS에 등록자 연구자나 공동 연구를 수행한 경험이 있는 연구자를 효율적으로 탐색할 수 있는 서비스를 제공하고 있다.
1. 마켓플레이스 등록 연구자
2. Pubmed 등재 연구자
동영상 매뉴얼
요청 메세지
요청 메세지
| 내용 * | |||
|---|---|---|---|
마켓플레이스 활용 시나리오
마켓플레이스 활용 시나리오
1. 데이터 또는 분석 도구 등을 기반으로 협업하고자 할 경우입니다.
<데이터셋 및 분석도구 자원 공유 흐름도>
1. 데이터셋 공유를 활용하고자 할 경우: 자원공유 중 데이터셋 메뉴에서 K-BDS 등록 데이터 및 연구자 보유 데이터 기반 협업 촉진을 목적으로 관련 정보 및 기능 제공합니다.
- 공개된 또는 공개 의향 데이터를 찾는 경우는 먼저 ① ‘자원공유’ 중 ‘데이터셋’ 메뉴에서 정보를 탐색하고, 데이터 탐색에 성공하면 ② 데이터의 상 세 정보와 샘플을 조회하며, 탐색에 실패하면 ③ ‘협업매칭’ 메뉴 에서 필요한 데이터를 게시합니다.
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여기서 데이터 탐색에 성공한 경우는 ⑤ 상세 데이터 공유 요청 등 데이터 활용에 대한 질의 및 상호 피드백 공유 기능을 활용합니다.
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만약 활동하고 있는 커뮤니티가 있는 경우 데이터셋 게시자를 해당 커뮤니티에 초대할 수 있습니다. (게시자 이름 클릭 또는 ‘협업지원’ 메뉴 검색)
- 보유한 데이터를 공유하고 협업하고자 하는 경우 먼저 ③ ‘협업매칭’ 메뉴에서 등록된 수요를 확인할 수 있으며, ④ ‘자원공유’ 메뉴에서 데이터에 대한 상세 정보(데이터 생산 관련 정보, 데이터 활용 연구 결과, 데이터 속성 정보 등)를 등록합니다.
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데이터셋 등록을 할 때 DOI가 부재한 경우 DOI부여가 가능하며, 데이터셋의 성격과 완성도를 고려해 잠정적으로 비공개할 수 있습니다.
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여기서 비공개 데이터를 공개 데이터로 변경하는 경우는 관리자가 상세정보를 모두 입력했는지 확인하는 프로세스가 추가됩니다.
2. 분석도구 공유를 활용하고자 할 경우: 자원공유 중 분석도구 메뉴에서 데이터 분석·활용 소프트웨어/파이프라인 등을 기반으로 한 협업 촉 진을 위한 관련 정보 및 기능 제공합니다.
- 탐색, 등록, 상호 피드백 등 구체적인 자원 공유 흐름은 상기 데이터 셋 자원 공유 흐름과 동일합니다.
2. 연구자 또는 커뮤니티를 기반으로 협업하고자 할 경우
<연구협력 지원 흐름도>
1. 연구자를 중심으로 협업을 진행하고자 할 경우: 연구자 및 기관의 협업 수요를 등록하고 공유할 수 있는 다양한 기능을 제공합니다.
- 연구자 협력 수요에 대응하여 ① ‘커뮤니티’ 메뉴에서 커뮤니티를 구성하고, ② ‘협업지원’에서 연구자를 검색한 후, 마켓플레이스 등록연구자로 확인되면 ③ 연구자의 관련 실적을 조회하거나, 검색에 실패하면 ④NTIS에서 관련 성과(논문 또는 과제)를 검색해 관련 연구자를 찾을 수 있습니다.
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여기서 연구자 탐색에 성공한 경우는 메일 보내기나 댓글로 질의 및 상호 피드백이 가능하고 나아가 커뮤니티에 초대할 수 있습니다.
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여기서 연구자 탐색에 실패한 경우는 ‘협업매칭’ 메뉴에서 연구자 등록 요청을 게시할 수 있습니다.
- 커뮤니티 구성보다 단순 참여를 원하는 연구자는 ⑤ ‘커뮤니티’ 메뉴에서 커뮤니티를 검색하고 관심 커뮤니티가 있다면 참여 신청할 수 있습니다.